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生信学习小组Day2笔记-Chocolate Ice

Linux简介

Linux与windows和Mac一样,是一个操作系统(OS)。但区别于windows和mac的图形界面,linux的操作靠命令行来实现。这样可以节约资源,方便批量、高效地处理文件,满足大数据分析的要求。因而Linux系统受到了广大生信研究者的青睐。

目录与路径概念在Linux系统中很重要。Linux中的目录相当于windows的文件夹,而路径就是目录的层级位置,比如,home目录下有个biosoft,那么biosoft的路径就是/home/biosoft。 ------微信公众号:生信星球

召唤Linux

接触使用Linux有多条途径。可以在个人电脑上安装Linux系统,但对于电脑的配置有要求,也可以通过本地服务器或者云服务器使用Linux。服务器与电脑相互独立,电脑的配置不会影响服务器的使用,服务器上的操作也不会影响到个人电脑。

1. 个人电脑的Linux

  • Windows10 (1)设置-更新和安全-针对开发人员-启用开发人员模式 (2)控制面板-控制面板-程序-启用或关闭windows功能-适用于Linux的windows子系统 (3)重启电脑 (4)下载ubuntu (5)启动ubuntu 和用户设置 (6)更新:输入sudo apt update,完成后输入sudo apt upgrade
  • Mac 不需要安装任何东西,自带terminal,直接使用;或者使用界面更好看的iterms

2. 本地服务器的Linux

实验室有服务器可以直接使用,登陆方法同云服务器

3. 云服务器的Linux

登陆方式:

Linux的基本操作

用tab键(键盘上q前面那个)可以补齐命令和文件名称,比如你想写huahua.txt,可以打出hua,按tab键,只要文件在当前目录下,文件名称就是可以自动补齐的,可避免代码拼写错误。------微信公众号:生信星球

1. pwd

pwd: print working directory

作用:pwd显示当前路径

示例:

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2. mkdir

mkdir: make directory

作用:mkdir tmp创建名为“tmp”的空目录

示例:

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3. ls

ls: list

作用:ls显示所在目录内的子目录/文件列表

示例:

生信学习小组Day2笔记-Chocolate Ice

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4. rm

rm: remove

作用:删除目录或文件

(1)rm file1: 删除file1文件

(2)rmdir tmp: 删除空目录"tmp" # rmdir: remove directory

(3)rm-r tmp2: 删除非空目录"tmp2" # -r:recursive,递归

(4)rm-rf tmp2: 不需提示的强制删除"tmp2 #-f:force,强制

示例:

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5. cd

cd: change directory

作用:进入某一目录

(1)cd tmp: 进入tmp目录

(2)cd -: 返回刚才目录

(3)cd cd~: 回到主目录

示例:

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6. vi

vi: visual interface

作用:新建脚本文档或者文本文档,并打开编辑

(1)vi file1: 新建文件,命名为file1 #自动打开编辑界面

(2)输入英文 i 键,进行输入

(3)按 Esc 键,退出编辑模式

(4)退出编辑后左下角键入 :x,保存并退出

7. cat

cat: concatenate

作用:连接文本文件内容,输出到屏幕

(1)cat file1:输出file1文件全部内容

(2)head file1:默认输出file1文件前10行

(3)tail file1:默认输出file1文件后10行

(4)head -n 3 file1:输出file1前3行 #head -n 数字 文件名

示例:

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8. cp

cp: copy

作用:复制文件

(1)cp file1 file2:复制file1,命名为file2

示例:

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9. mv

mv: move

作用:将文件移入文件夹,或者重命名

(1)mv file1 ~/tmp: 将file1文件移入home/tmp目录下 #mv 文件名 路径

(2)mv file1 file2: 将file1重命名为file2

示例:

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Day2总结

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